设立方式：子公司是公司股东依据《公司法》相关规定设立，设立过程需严格满足《公司法》中有关设立条件和投资方式的要求。而分公司则由总公司在其住所地以外的地区，向当地工商机关申请设立，本质上属于公司设立的一种特殊形式。
法律地位：子公司是独立法人，具备法人资格，拥有独立的名称、章程以及组织机构，在对外经营活动中，均以自身名义开展业务。与之不同的是，分公司不具备法人资格，没有独立的名称、公司章程和组织机构，只能以总公司分支机构的名义进行经营。
受控制方式：母公司对子公司的控制通常并非直接干预，而是通过任免子公司董事会成员以及做出投资决策等手段，间接影响子公司的生产经营活动。分公司的人事、业务以及财产均直接受总公司控制，在总公司规定的经营范围内开展经营活动。
承担债务责任方式：作为独立法人，子公司以自身全部财产为限，对其经营过程中产生的负债承担责任。母公司作为子公司的最大股东，仅以其对子公司的出资额为限，对子公司经营活动中的债务承担责任。分公司的民事责任则由总公司承担。
营业执照：子公司需要领取独立的营业执照，以此作为其合法经营的凭证；分公司不需要领取独立营业执照。
产品包装标注：子公司在产品外包装上，必须标注自身的名称和住所。分公司在产品包装标注上则更为灵活，可以标注自己的名称和住所，也可以同时标注总公司的名称和住所，或者仅标注总公司的名称和住所。
征税方面：子公司作为独立法人，母公司和子公司需分别进行纳税，且子公司只有在缴纳完税款后的利润中，才能按照股东所占股份进行股利分配。分公司并非独立法人，其实现的盈亏需与总公司合并计算纳税。
